Colonia es un departamento estratégico para el movimiento internacional.

Los puertos de Juan Lacaze y Colonia del Sacramento transportan permanentemente cargas y pasajeros con Argentina.

Los puertos de Nueva Palmira y Conchillas transportan mercaderías con el resto del mundo.

Este ultimo mencionando es uno de los más importantes del Uruguay, ya que el mismo se encuentra en el km. cero de la hidrovía Paraná-Paraguay.